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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

“阳过”了，春节回家可以摘口罩吗？专家最新解答******

　　春节期间，人员流动性增大。作为自己健康的“第一责任人”，“阳过”是不是可以摘口罩了？武汉市疾控中心传染病防制所所长杨小兵详解。

　　杨小兵介绍，1月8日新冠病毒感染实施“乙类乙管”，防控措施进一步优化调整。当前，正值新冠病毒感染及流感等其他呼吸道传染病流行季节，社会面传染源更加不确定，对于还没有感染的市民，更要做好个人防护，出入商场、医院等人群密集场所，乘坐飞机、火车等密闭的交通工具，坚持戴好口罩非常重要。

　　同时，杨小兵强调，疫苗接种仍然是预防控制传染病最经济最有效的手段，现阶段使用的新冠病毒疫苗对防感染、防重症及减少死亡仍有很好的效果，呼吁尚未接种新冠病毒疫苗或尚未完成全程接种、加强接种的市民要尽快接种疫苗，赶在春节人员流动高峰前获得较好的保护。特别是60岁以上的老年人群和有慢性基础性疾病的人群，感染新冠病毒后容易加重自身基础性疾病，因此，呼吁老年人群特别是80岁以上的高龄老人尽快接种新冠病毒疫苗，早接种、早保护。

　　那么，在即将到来的春节长假，已经“阳过”的人群还需要继续戴口罩吗？还会再次感染吗？杨小兵介绍，感染新冠病毒后，免疫功能正常的人群体内都会对新冠病毒产生一定抵抗力，短时间内再次感染其他奥密克戎变异株的可能性较小，但冬春季节同时也是流感等呼吸道传染病高发期，建议个人防护莫降级，以免刚刚“阳康”又感染其他疾病。此外，感染新冠病毒经过较长一段时间后，抗体保护作用下降，遇到免疫逃逸能力强的毒株，不排除少数康复者特别是免疫低下的人群可能会再次感染。

　　杨小兵说，在过去几年里，由于人们保持戴口罩、勤洗手等良好的个人防护措施和卫生习惯，使大家在很大程度上免于多种呼吸道传染病的侵扰。虽然防控措施调整了，但良好的卫生习惯还要坚持。建议春节长假期间市民朋友仍要做好个人防护，不要放松警惕，包括戴口罩、居家房间勤通风、注意手卫生、保持一米距离、不扎堆、少聚集等，平安健康迎接新年。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）